Tag: hydroponic farming

  • The above chronology shows how the spraying of marijuana and coca began in Colombia

    Shortly afterwards, the Colombian government brought together a number of experts and created a scientific commission to examine the use of fumigation with herbicides for attacking marijuana production. This commission opposed the use of chemical substances. From there, the issue was passed on to the National Council on Narcotics which had been set up in 1974.…

  • Poor diet quality may contribute to the high prevalence of adolescent obesity

    This supports an urgent need to educate adolescents as they transition to experiencing more autonomy in food choices and other lifestyle behaviors that arise with emerging adulthood.Over 50% of youth had poor diet quality in 2016. Youth are well below meeting dietary recommendations despite having quite high nutritional requirements to support a period of immense…

  • An effective vaccine is the best long-term solution to COVID-19 and other pandemics

    Under the animal rule, efficacy is established based on adequate and well-controlled studies in animal models of the human disease or condition of interest, and safety is evaluated under the pre-existing requirements for drugs and biologic products.As an example, the plant-derived mAb cocktail ZMapp for Ebola virus disease, manufactured by Kentucky Bioprocessing for Mapp Biopharmaceutical…

  • CBCVd is the smallest of the known citrus viroids and is closely related to CEVd

    CEVd has a wide host range and has been identified naturally infecting hosts other than citrus. CEVd is the largest among citrus viroids and has the unique property of spontaneously increasing in length its RNA genome by terminal repeats after prolonged infections on specific solanaceous hosts. Hop stunt viroidis the causal agent of the cachexia and…

  • Government-sponsored safety nets for rural dwellers remain conspicuous by their absence

    Analyzing the effect of risk on risk taking by farmers in developing countries is harder to do. It is empirically difficult to formally test theories that relate decisions made by poor households with the relative riskiness of the options available to them. There two main reasons for this. First, it is very difficult to obtain…

  • It has been proposed that CH4 is produced abiotically in aerobic plant tissue

    Methane is produced abiotically from combustion of organic carbon during biomass burning and by thermal alteration of sedimentary organic carbon.Despite generally inhospitable conditions, there is abundant evidence of methanogenic activity in upland soils. Andersen et al. used a 14CH4-labeling technique to infer that two forest soils produced CH4 even though the soils as a whole were net…

  • Differences in peak profiles can be caused by incomplete restriction digest

    While the relative ratio of ectomycorrhizal fungi to saprotrophic fungi is much higher in the mineral soil , there are likely to be many saprotrophic fungi in the mineral soil, and we had planned to eliminate these from our dataset by using a database of known ectomycorrhizal fungi. We attempted to use an extensive collection of ectomycorrhizal sporocarps in conjunction with cloning and sequencing to build a reference database of known TRFLP types, similar to the method used by Dickie et al. . We had many problems assembling this database so we had to restrict our analysis to a “fingerprint” of the total fungal community. We did, however, assemble 6 clone libraries from a total of 36 of our samples . Of 118 sequenced clones, 56% were attributed to being of ectomycorrhizal origin, belonging to 22 operational taxonomic units , and 44% were either known or suspected saprotrophic fungi, belonging to 24 OTU’s. Clones were picked after examination by gel electrophoresis in order to maximize taxonomic coverage of our sequencing so clone abundance cannot be taken as an accurate indication of relative distribution. However, since there were more OTU’s of putatively saprotrophic fungi, and more clones of ectomycorrhizal origin, it seems reasonable to conclude that at least half of our TRFLP peaks profiles are of ectomycorrhizal fungi. However, given the significant amount of saprotrophic diversity observed, we do not know whether the observed shifts in fungal community composition are due to shifts in saprotrophic community or ectomycorrhizal community, and this has significant implications for the interpretation of our results.Parent material was the dominant factor shaping fungal community across the 6 soil pits. Soils formed from different parent materials can be expected to vary in many respects as a result of the mineral from which they formed Across both parent materials all soil chemical characteristics we examined varied significantly with parent material, and the soil chemical factors that varied most with parent material were the most strongly associated with fungal community composition.  Given that carbon was strongly associated with fungal community composition at the pit scale but very weakly across both parent materials,cultivo frambues  it is clear that location or parent material exerts a strong influence on fungal community composition, but we cannot assess the relative importance of any particular chemical factor in determining fungal community composition at this broad scale.  When examining the effect of parent material, we cannot separate the effects of chemistry from the role of geographic location in shaping fungal community. Rainfall and sea salt inputs may contribute to the different communities observed on the different parent materials. The elevation of the sandstone plots is approximately 150 meters lower than the granite plots, and the sandstone plots are located approximately 2km closer to the sea . As a result of these geographic factors, the annual rainfall is approximately 10% higher, and one can assume that any ocean derived salt inputs from precipitation significantly higher at the sandstone plots. Sea salt inputs have been shown to significantly lower soil pH and this may explain the lower pH of the soils formed on sandstone. The higher precipitation inputs may be expected to have significant effects on the fungal community of these seasonally dry soils, though at the time of our sampling we were 1 month into the wet season, and we did not detect any significant difference in soil moisture between the different soils . On each parent material, carbon content and depth stand out as the dominant variables that correlate with fungal community composition. Magnesium and calcium are strongly associated with fungal community composition, but Ca and Mg also correlate strongly with pit. Calcium is significantly associated with fungal community composition in one pit on each parent material including pit 3 on the granite derived soil. This pit also has the lowest calcium content of all pits. Overall though, the lack of a consistent effect of calcium, nor any significant effect of magnesium on fungal community at the pit scale, in conjunction with their tendency to vary considerably between pits suggests that Mg and Ca contents may be proxies for pit location and not significant factors in shaping fungal community composition. Sodium is strongly associated with fungal community composition on soils formed from sandstone, but Na is not a macro-nutrient for plants, and it is more abundant in soils formed from sandstone parent material. Given that it forms less than 5% of extractable cations it seems unlikely that Na is driving fungal community composition. Pit 6 on sandstone, had a significantly different fungal community than pits 4 and 5 and markedly higher sodium content.  While it did not appear to have a more ocean facing aspect than the other pits , it is possible that the higher exchangeable Na from this pit is a marker of significantly higher sea salt effects. However, we would expect a lower pH and lower contents of non marine base cations to be associated with markedly higher sea salt inputs, and we did not observe this. The strong association between fungal community and carbon content suggests that the differences we observed in the fungal community may be primarily driven by shifts in the saprotrophic fungal community. While carbon correlates with nitrogen, pH and base cations across all soil samples, it consistently stands out as the dominant factor shaping community composition. There is evidence that ectomycorrhizal fungi can obtain energy from soil carbon , but saprotrophic activity by ectomycorrhizal fungi appears to only be significant when carbon allocation by the host plant is cut off , and we sampled the fungal community during the period of maximum carbon allocation to roots. Given that these forests are considered to be nitrogen limited, and there was considerable range of nitrogen content observed,maceta cuadrada  we would expect nitrogen to be an important determinant of fungal community composition if the observed changes in the fungal community were driven by shifts in the distribution and abundance of ectomycorrhizal fungi. Nitrogen was only associated with fungal community composition in two pits, and only marginally significantly . The carbon to nitrogen ratio was 9.5 across all soils ; this is well below the fungal biomass C:N ratio , indicating that the saprotrophic fungal community is limited by carbon availability. The lack of a strong effect of nitrogen or potassium on fungal community composition and the low soil C:N suggest that the relationship between soil carbon and fungal community is driven by shifts in the saprotrophic fungal community. Our finding that carbon content was very strongly associated with fungal community composition is not in agreement with other studies in forests, though no studies have examined the effects of mineral soil carbon distribution on fungal community composition in forests. Lauber et al. and Kasel et al. both compared fungal communities across multiple forest types and failed to find an effect of soil carbon content on fungal community. However, both studies took large soil samples that included the litter layer, organic horizon and only the top few cm of mineral soil, and any carbon effects were thus dominated by the thickness of the organic horizon and litter layer.  These are, to the author’s knowledge, the only studies that have investigated the role of soil carbon in determining fungal community composition in forest soils. A number of studies have investigated the effect of soil carbon content in the mineral soil on microbial community composition in grasslands, and carbon content is consistently found to be the chemical factor most strongly correlated with fungal community composition . To the author’s knowledge, the only studies investigating depth effects on fungal community composition in forests have done so by comparing the ectomycorrhizal community on root tips between soil horizons. These studies consistently find a strong effect of horizon on ectomycorrhizal fungal community composition . A number of studies have found a strong association between total fungal community composition and depth in grassland soils. Robinson et al. used nearly identical TRFLP fingerprinting methods to ours to determine the effect of depth on the fungal community composition in a grassland soil approximately 5 km from our study site. They sampled 2 depths and found that across a wide range of spatial scales the TRFLP profiles of the fungal community were more similar between different cores taken from the same depth than between the two depths of an individual soil core .Moore et al. , Allison et al. , and Fierer et al. found that, though very strongly associated with carbon, depth was an even stronger determinant of fungal community than carbon alone. Allison et al. and Moore et al. both suggest that carbon is the most important depth related factor in determining fungal community composition, but also indicate that calcium availability may be an important component of the association of microbial community composition with depth. Rooting distribution, and the associated exudation of labile carbon may also exert a controlling effect on fungal community composition in forest soils , and this may be another depth related factor controlling fungal community composition. There are limitations associated with using terminal restriction fragment length polymorphism as a community “fingerprinting” method .Multiple OTU’s may yield the same peak profile, and individual taxa may yield multiple restriction profiles. Compiling a database of peak profiles from known fungal species will reduce the deleterious effects of these potential sources of error in TRFLP methods. However, TRFLP fingerprinting methods are reproducible , and widely used. Our methods were internally consistent, and our results were sufficiently strong and our sampling sufficiently intensive that we do not believe that these possible sources of error caused spurious correlations. One limitation of any community profiling method that we have already addressed is that it cannot be used to isolate polyphyletic groups, such as ectomycorrhizal fungi. A limitation of any molecular method involving DNA extraction from soil is that we cannot separate the potential contributions of fungal spores from that of fungal hyphae to our peak profiles, but we find that only very high levels of spores can be detected .Our sampling strategy was flawed in its spatial design due to incorrectassumptions about the soil chemical variability we would encounter. We were unable to determine the relative importance of geographic location or certain soil chemical factors strongly associated with fungal community in shaping fungal community composition. We anticipated more variation in soil chemical variables within pits and less between pits or parent materials. We designed our sampling strategy to maximize soil chemical variability, but we did so underestimating how much soil chemistry would vary with distance. We assumed that auto correlation of fungal community with distance would drop so rapidly that pit separated by more than 5 meters should be independent. , but given that we cannot separate the effects of distance from the effects of parent material, magnesium, nitrogen, sodium, pH, or calcium on fungal community composition, this may not be true at the scale we have sampled. Calcium, though, does appear to be more strongly associated with fungal community than location alone could explain. Phosphorous is an important nutrient, and we neglected to include it in our soil chemical analysis because we did not think we would have enough material left over from our very small soil samples after analyzing the seven parameters we analyzed to perform phosphorous analysis. In actuality, we had extra material and likely could have both collected smaller samples and performed phosphorous analysis. Ectomycorrhizae are considered to be weathering agents in temperate and boreal ecosysytems . There is considerable debate about the significance of this biotic component of weathering. Understanding and quantifying the ectomycorrhizal contribution to mineral weathering may be particularly important to forest managers attempting to minimize time between stand harvest without depleting mineral nutrient levels in the soil and to policy makers determining critical loads of atmospheric pollutants. Ectomycorrhizal fungal communities are dynamic, composed of many species, with somewhat discreet ecological niches. Nitrogen deposition and increasing CO2 levels have been observed to cause a shift in the community composition of ectomycorrhizal fungi in a given forest. While it is unclear what causes these changes, it has been suggested that trees may be selecting for ECM species that best satisfy the host plant’s altered nutrient demand . 

  • Temporality engenders resentment and repetition of that which humans cannot change

    Thus the abjection written into the production of plastic water bottles by American companies mirrors the disposability attributed to Vietnamese lives by US necropolitics. Urine coloring the yellow star of the US and Vietnamese flag can be interpreted as the collapse of “official” delineations marking past and present US Vietnam relations through the memory of water…

  • These studies examined two dry down events of varying severity during 2015 and 2016

    With II treatments, flooding and drying events induced redox fluctuations. During drying events, diffusion of atmospheric oxygen into the anoxic soil results in a rapid increase in redox potential , with increased drying time leading to more oxic conditions. These redox fluctuations directly impact the speciation of many elements in the soil, including As and…

  • Nitrate is absorbed from the external environment into the roots by nitrate transporters

    Studies that compare remediation efficiencies of natural attenuation, bio augmentation, phytoremediation and rhizoremedation, under field conditions , assess bacterial colonization and activity on plant roots, and measure allometric relationships of tree trunk size and various root parameters provide invaluable information for determining field application options and evaluating contaminant removal. More extensive, long term field comparisons of control plots with treatment…